阮公祠景区在城隍阁东，包括阮公祠、青衣洞、元宝心66号历史建筑和石观音阁、宝成寺、感花岩等景点。

去阮公祠有三条路———从城隍阁下售票亭东面的一条游步道下山；从十二生肖石东面的一条游步道下山；或从十五奎巷上山，沿着元宝心路一直走，到山脚边就可看到。

阮公祠主体建筑按晚清风格原样恢复，两边厢房和山门是新建的；主殿两旁用来表现阮元功绩的四幅绢画，用的是杭州最好的丝绸。

主殿后的山壁上，有很多摩崖石刻，如“吴山福地”等，都是新发现的。

元宝心66号的进门墙壁上，有块厚厚的有机玻璃，挡着一堵黄土墙———这种透明方式，为了让游客看看以前老房子的黄土墙是怎样的。

以前吴山上泉脉众多，但后来大都逐渐枯竭，整治之前只剩青衣泉了。这次整治中，吴山上恢复了三处泉：洗心池（石观音阁主殿西北）、不二泉（石观音阁北）和雨泉（66号建筑南）———其中雨泉下埋了自来水管，如果连续几天不下雨，你看到的雨泉水其实是自来水；另外两泉，泉脉未完全枯竭，仍是天然水。

从石观音阁南的游步道下去，是感花岩和国家级文保单位宝成寺。

“喀斯特地貌”是吴山一大特色，从石观音阁南面休息亭后的游步道一直往前走，朝山下望就是吴山上最大的一处喀斯特地貌，整面山被水溶得千疮百孔，有的像石笋，有的像石柱，有的是大溶洞。